Faculté des sciences

Peptide identification by tandem mass spectrometry : a tag-oriented open-modification search method

Hernandez, Patricia ; Appel, Ron David (Dir.) ; Gras, Robin (Codir.)

Thèse de doctorat : Université de Genève, 2005 ; Sc. 3698.

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    Résumé
    Dans la majorité des projets de recherche en protéomique, il faut, à un moment ou un autre, déterminer l'identité des protéines présentes dans l'échantillon biologique étudié. Généralement, la méthode utilisée est la corrélation de spectres obtenus par spectrométrie de masse avec des séquences protéiques répertoriées dans des banques de données. Nous avons développé une méthode pour identifier des protéines portant des modifications non attendues. Lorsque les spectres contiennent suffisamment d'information, il est possible de spécifier la position et la nature des modifications présentes.